Для подобных ситуаций предусмотрена штатная возможность подачи корректирующей декларации. Вам необходимо исправить ошибки в декларации, поставить признак корректирующей декларации, номер коррекции и сформировать файл. Затем заново проделать шаги необходимые для подачи декларации.